Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn13Q9Z0S4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn13Q9Z0S4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn13Q9Z0S4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn13Q9Z0S4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn13Q9Z0S4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn13Q9Z0S4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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