Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E2

Chrd, Chordin, mousemouse

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrdQ9Z0E2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ChrdQ9Z0E2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ChrdQ9Z0E2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ChrdQ9Z0E2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ChrdQ9Z0E2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChrdQ9Z0E2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChrdQ9Z0E2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ChrdQ9Z0E2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChrdQ9Z0E2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms