Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUN8

Lbx2, Transcription factor LBX2, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx2Q9WUN8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lbx2Q9WUN8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lbx2Q9WUN8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lbx2Q9WUN8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lbx2Q9WUN8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lbx2Q9WUN8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lbx2Q9WUN8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lbx2Q9WUN8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lbx2Q9WUN8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lbx2Q9WUN8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms