Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lhx9Q9WUH2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lhx9Q9WUH2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lhx9Q9WUH2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lhx9Q9WUH2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lhx9Q9WUH2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lhx9Q9WUH2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lhx9Q9WUH2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lhx9Q9WUH2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lhx9Q9WUH2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms