Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdcd6ipQ9WU78 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdcd6ipQ9WU78 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdcd6ipQ9WU78 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdcd6ipQ9WU78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd6ipQ9WU78 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdcd6ipQ9WU78 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdcd6ipQ9WU78 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdcd6ipQ9WU78 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdcd6ipQ9WU78 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pdcd6ipQ9WU78 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdcd6ipQ9WU78 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd6ipQ9WU78 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdcd6ipQ9WU78 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdcd6ipQ9WU78 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdcd6ipQ9WU78 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pdcd6ipQ9WU78 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms