Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1gQ9WU39 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Scnn1gQ9WU39 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Scnn1gQ9WU39 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scnn1gQ9WU39 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scnn1gQ9WU39 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scnn1gQ9WU39 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Scnn1gQ9WU39 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scnn1gQ9WU39 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scnn1gQ9WU39 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scnn1gQ9WU39 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scnn1gQ9WU39 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms