Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Spo11Q9WTK8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Spo11Q9WTK8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Spo11Q9WTK8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Spo11Q9WTK8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Spo11Q9WTK8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Spo11Q9WTK8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Spo11Q9WTK8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms