Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Plxnb3Q9QY40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Plxnb3Q9QY40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Plxnb3Q9QY40 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Plxnb3Q9QY40 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Plxnb3Q9QY40 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Plxnb3Q9QY40 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Plxnb3Q9QY40 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Plxnb3Q9QY40 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Plxnb3Q9QY40 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plxnb3Q9QY40 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Plxnb3Q9QY40 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Plxnb3Q9QY40 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plxnb3Q9QY40 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Plxnb3Q9QY40 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Plxnb3Q9QY40 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms