Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXU7

Prok2, Prokineticin-2, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prok2Q9QXU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prok2Q9QXU7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prok2Q9QXU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prok2Q9QXU7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prok2Q9QXU7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prok2Q9QXU7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prok2Q9QXU7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prok2Q9QXU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prok2Q9QXU7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms