Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX11

Cyth1, Cytohesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyth1Q9QX11 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyth1Q9QX11 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cyth1Q9QX11 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cyth1Q9QX11 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cyth1Q9QX11 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cyth1Q9QX11 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cyth1Q9QX11 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Cyth1Q9QX11 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cyth1Q9QX11 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cyth1Q9QX11 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cyth1Q9QX11 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms