Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdc42ep4Q9JM96 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc42ep4Q9JM96 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdc42ep4Q9JM96 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdc42ep4Q9JM96 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc42ep4Q9JM96 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc42ep4Q9JM96 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdc42ep4Q9JM96 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdc42ep4Q9JM96 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42ep4Q9JM96 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdc42ep4Q9JM96 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdc42ep4Q9JM96 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdc42ep4Q9JM96 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdc42ep4Q9JM96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdc42ep4Q9JM96 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cdc42ep4Q9JM96 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cdc42ep4Q9JM96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms