Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RabggtaQ9JHK4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RabggtaQ9JHK4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RabggtaQ9JHK4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RabggtaQ9JHK4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RabggtaQ9JHK4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RabggtaQ9JHK4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RabggtaQ9JHK4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RabggtaQ9JHK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RabggtaQ9JHK4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
RabggtaQ9JHK4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RabggtaQ9JHK4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RabggtaQ9JHK4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RabggtaQ9JHK4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RabggtaQ9JHK4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RabggtaQ9JHK4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RabggtaQ9JHK4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RabggtaQ9JHK4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
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