Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cxcl11Q9JHH5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cxcl11Q9JHH5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cxcl11Q9JHH5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cxcl11Q9JHH5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cxcl11Q9JHH5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Cxcl11Q9JHH5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cxcl11Q9JHH5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cxcl11Q9JHH5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cxcl11Q9JHH5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cxcl11Q9JHH5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Cxcl11Q9JHH5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cxcl11Q9JHH5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cxcl11Q9JHH5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.4 ms