Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN4

C1ql3, Complement C1q-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1ql3Q9ESN4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1ql3Q9ESN4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1ql3Q9ESN4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1ql3Q9ESN4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C1ql3Q9ESN4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C1ql3Q9ESN4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1ql3Q9ESN4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C1ql3Q9ESN4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C1ql3Q9ESN4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1ql3Q9ESN4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1ql3Q9ESN4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1ql3Q9ESN4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1ql3Q9ESN4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C1ql3Q9ESN4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.3 ms