Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Irx6Q9ER75 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Irx6Q9ER75 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Irx6Q9ER75 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Irx6Q9ER75 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Irx6Q9ER75 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Irx6Q9ER75 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Irx6Q9ER75 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Irx6Q9ER75 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Irx6Q9ER75 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Irx6Q9ER75 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Irx6Q9ER75 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Irx6Q9ER75 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Irx6Q9ER75 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Irx6Q9ER75 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Irx6Q9ER75 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms