Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Yipf5Q9EQQ2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Yipf5Q9EQQ2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Yipf5Q9EQQ2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Yipf5Q9EQQ2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Yipf5Q9EQQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Yipf5Q9EQQ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Yipf5Q9EQQ2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms