Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQB9

Znf287, Zinc finger protein 287, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf287Q9EQB9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Znf287Q9EQB9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Znf287Q9EQB9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Znf287Q9EQB9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Znf287Q9EQB9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Znf287Q9EQB9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Znf287Q9EQB9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Znf287Q9EQB9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Znf287Q9EQB9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Znf287Q9EQB9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Znf287Q9EQB9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms