Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Clstn1Q9EPL2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Clstn1Q9EPL2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Clstn1Q9EPL2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Clstn1Q9EPL2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Clstn1Q9EPL2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Clstn1Q9EPL2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Clstn1Q9EPL2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Clstn1Q9EPL2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Clstn1Q9EPL2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms