Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpr88Q9EPB7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpr88Q9EPB7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gpr88Q9EPB7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gpr88Q9EPB7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gpr88Q9EPB7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpr88Q9EPB7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpr88Q9EPB7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpr88Q9EPB7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gpr88Q9EPB7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms