Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rarres2Q9DD06 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rarres2Q9DD06 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rarres2Q9DD06 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rarres2Q9DD06 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rarres2Q9DD06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rarres2Q9DD06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rarres2Q9DD06 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rarres2Q9DD06 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rarres2Q9DD06 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rarres2Q9DD06 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rarres2Q9DD06 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rarres2Q9DD06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms