Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBI0

Tmprss6, Transmembrane protease serine 6, mousemouse

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss6Q9DBI0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmprss6Q9DBI0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmprss6Q9DBI0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmprss6Q9DBI0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmprss6Q9DBI0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tmprss6Q9DBI0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tmprss6Q9DBI0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tmprss6Q9DBI0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmprss6Q9DBI0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmprss6Q9DBI0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss6Q9DBI0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss6Q9DBI0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss6Q9DBI0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmprss6Q9DBI0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmprss6Q9DBI0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms