Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB00

Gon4l, GON-4-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gon4lQ9DB00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gon4lQ9DB00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gon4lQ9DB00 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gon4lQ9DB00 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gon4lQ9DB00 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gon4lQ9DB00 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gon4lQ9DB00 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gon4lQ9DB00 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gon4lQ9DB00 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gon4lQ9DB00 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gon4lQ9DB00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms