Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sgf29Q9DA08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sgf29Q9DA08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sgf29Q9DA08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sgf29Q9DA08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sgf29Q9DA08 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sgf29Q9DA08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgf29Q9DA08 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sgf29Q9DA08 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sgf29Q9DA08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sgf29Q9DA08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sgf29Q9DA08 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sgf29Q9DA08 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sgf29Q9DA08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms