Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf2Q9D8U4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C1qtnf2Q9D8U4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
C1qtnf2Q9D8U4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C1qtnf2Q9D8U4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1qtnf2Q9D8U4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
C1qtnf2Q9D8U4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qtnf2Q9D8U4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qtnf2Q9D8U4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
C1qtnf2Q9D8U4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qtnf2Q9D8U4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
C1qtnf2Q9D8U4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
C1qtnf2Q9D8U4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C1qtnf2Q9D8U4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1qtnf2Q9D8U4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C1qtnf2Q9D8U4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C1qtnf2Q9D8U4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1qtnf2Q9D8U4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
C1qtnf2Q9D8U4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms