Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem41aQ9D8U2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem41aQ9D8U2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem41aQ9D8U2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem41aQ9D8U2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem41aQ9D8U2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem41aQ9D8U2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem41aQ9D8U2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms