Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rpl4Q9D8E6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl4Q9D8E6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl4Q9D8E6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rpl4Q9D8E6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rpl4Q9D8E6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rpl4Q9D8E6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rpl4Q9D8E6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rpl4Q9D8E6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rpl4Q9D8E6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rpl4Q9D8E6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpl4Q9D8E6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rpl4Q9D8E6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rpl4Q9D8E6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rpl4Q9D8E6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rpl4Q9D8E6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rpl4Q9D8E6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rpl4Q9D8E6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms