Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6V8

Paip2, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip2Q9D6V8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paip2Q9D6V8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Paip2Q9D6V8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paip2Q9D6V8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paip2Q9D6V8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paip2Q9D6V8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Paip2Q9D6V8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paip2Q9D6V8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Paip2Q9D6V8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Paip2Q9D6V8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Paip2Q9D6V8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Paip2Q9D6V8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Paip2Q9D6V8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms