Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc81Q9D5W4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc81Q9D5W4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc81Q9D5W4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc81Q9D5W4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc81Q9D5W4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc81Q9D5W4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc81Q9D5W4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc81Q9D5W4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc81Q9D5W4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc81Q9D5W4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc81Q9D5W4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc81Q9D5W4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc81Q9D5W4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc81Q9D5W4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc81Q9D5W4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms