Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tmem30cQ9D4D7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tmem30cQ9D4D7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tmem30cQ9D4D7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tmem30cQ9D4D7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tmem30cQ9D4D7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmem30cQ9D4D7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmem30cQ9D4D7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmem30cQ9D4D7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmem30cQ9D4D7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms