Protein–RNA interactions for Protein: Q9D498

Iqcf3, IQ domain-containing protein F3, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf3Q9D498 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Iqcf3Q9D498 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Iqcf3Q9D498 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Iqcf3Q9D498 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Iqcf3Q9D498 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Iqcf3Q9D498 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Iqcf3Q9D498 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Iqcf3Q9D498 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Iqcf3Q9D498 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Iqcf3Q9D498 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Iqcf3Q9D498 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Iqcf3Q9D498 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Iqcf3Q9D498 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Iqcf3Q9D498 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Iqcf3Q9D498 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142 ms