Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
4933428G20RikQ9D3X4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
4933428G20RikQ9D3X4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.82□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC8.81□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC8.79□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC8.78□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
4933428G20RikQ9D3X4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
4933428G20RikQ9D3X4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms