Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V5

Fsip1, Fibrous sheath-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fsip1Q9D3V5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Fsip1Q9D3V5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Fsip1Q9D3V5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Fsip1Q9D3V5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Fsip1Q9D3V5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Fsip1Q9D3V5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Fsip1Q9D3V5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fsip1Q9D3V5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fsip1Q9D3V5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Fsip1Q9D3V5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Fsip1Q9D3V5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms