Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
D930007J09RikQ9D2K6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
D930007J09RikQ9D2K6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
D930007J09RikQ9D2K6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
D930007J09RikQ9D2K6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
D930007J09RikQ9D2K6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
D930007J09RikQ9D2K6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
D930007J09RikQ9D2K6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
D930007J09RikQ9D2K6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
D930007J09RikQ9D2K6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms