Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH3

3300002I08Rik, RIKEN cDNA 3300002I08, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3300002I08RikQ9CXH3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
3300002I08RikQ9CXH3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
3300002I08RikQ9CXH3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
3300002I08RikQ9CXH3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
3300002I08RikQ9CXH3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
3300002I08RikQ9CXH3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
3300002I08RikQ9CXH3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
3300002I08RikQ9CXH3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
3300002I08RikQ9CXH3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
3300002I08RikQ9CXH3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms