Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EcdQ9CS74 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EcdQ9CS74 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EcdQ9CS74 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EcdQ9CS74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EcdQ9CS74 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
EcdQ9CS74 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EcdQ9CS74 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms