Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Med30Q9CQI9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Med30Q9CQI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Med30Q9CQI9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Med30Q9CQI9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Med30Q9CQI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Med30Q9CQI9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms