Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Chmp3Q9CQ10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Chmp3Q9CQ10 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Chmp3Q9CQ10 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Chmp3Q9CQ10 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Chmp3Q9CQ10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Chmp3Q9CQ10 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Chmp3Q9CQ10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Chmp3Q9CQ10 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chmp3Q9CQ10 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Chmp3Q9CQ10 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chmp3Q9CQ10 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chmp3Q9CQ10 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Chmp3Q9CQ10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Chmp3Q9CQ10 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Chmp3Q9CQ10 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Chmp3Q9CQ10 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp3Q9CQ10 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Chmp3Q9CQ10 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms