Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Atg3Q9CPX6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atg3Q9CPX6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Atg3Q9CPX6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Atg3Q9CPX6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Atg3Q9CPX6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atg3Q9CPX6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Atg3Q9CPX6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Atg3Q9CPX6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Atg3Q9CPX6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Atg3Q9CPX6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Atg3Q9CPX6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Atg3Q9CPX6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atg3Q9CPX6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Atg3Q9CPX6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Atg3Q9CPX6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atg3Q9CPX6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Atg3Q9CPX6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Atg3Q9CPX6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Atg3Q9CPX6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Atg3Q9CPX6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Atg3Q9CPX6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Atg3Q9CPX6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Atg3Q9CPX6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Atg3Q9CPX6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Atg3Q9CPX6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Atg3Q9CPX6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Atg3Q9CPX6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms