Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rassf3Q99P51 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rassf3Q99P51 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rassf3Q99P51 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rassf3Q99P51 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rassf3Q99P51 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rassf3Q99P51 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rassf3Q99P51 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Rassf3Q99P51 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Rassf3Q99P51 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Rassf3Q99P51 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rassf3Q99P51 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rassf3Q99P51 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rassf3Q99P51 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rassf3Q99P51 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms