Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS1

Mmadhc, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type D homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MmadhcQ99LS1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MmadhcQ99LS1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MmadhcQ99LS1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MmadhcQ99LS1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MmadhcQ99LS1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MmadhcQ99LS1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MmadhcQ99LS1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MmadhcQ99LS1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms