Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Smarcd2Q99JR8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcd2Q99JR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcd2Q99JR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Smarcd2Q99JR8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Smarcd2Q99JR8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Smarcd2Q99JR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Smarcd2Q99JR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Smarcd2Q99JR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Smarcd2Q99JR8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Smarcd2Q99JR8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smarcd2Q99JR8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smarcd2Q99JR8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcd2Q99JR8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcd2Q99JR8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcd2Q99JR8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Smarcd2Q99JR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smarcd2Q99JR8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smarcd2Q99JR8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smarcd2Q99JR8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcd2Q99JR8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcd2Q99JR8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smarcd2Q99JR8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms