Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neurl1Q923S6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neurl1Q923S6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neurl1Q923S6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurl1Q923S6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neurl1Q923S6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Neurl1Q923S6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Neurl1Q923S6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Neurl1Q923S6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms