Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Sirt1Q923E4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Sirt1Q923E4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Sirt1Q923E4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sirt1Q923E4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Sirt1Q923E4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Sirt1Q923E4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sirt1Q923E4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
Sirt1Q923E4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sirt1Q923E4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sirt1Q923E4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sirt1Q923E4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sirt1Q923E4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sirt1Q923E4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Sirt1Q923E4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Sirt1Q923E4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sirt1Q923E4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Sirt1Q923E4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Sirt1Q923E4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sirt1Q923E4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sirt1Q923E4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sirt1Q923E4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms