Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slc5a4bQ91ZP4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Slc5a4bQ91ZP4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Slc5a4bQ91ZP4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Slc5a4bQ91ZP4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Slc5a4bQ91ZP4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Slc5a4bQ91ZP4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slc5a4bQ91ZP4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Slc5a4bQ91ZP4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Slc5a4bQ91ZP4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Slc5a4bQ91ZP4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Slc5a4bQ91ZP4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Slc5a4bQ91ZP4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Slc5a4bQ91ZP4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Slc5a4bQ91ZP4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
Slc5a4bQ91ZP4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slc5a4bQ91ZP4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Slc5a4bQ91ZP4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Slc5a4bQ91ZP4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Slc5a4bQ91ZP4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Slc5a4bQ91ZP4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Slc5a4bQ91ZP4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Slc5a4bQ91ZP4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms