Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tm4sf4Q91XD3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tm4sf4Q91XD3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tm4sf4Q91XD3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tm4sf4Q91XD3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tm4sf4Q91XD3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tm4sf4Q91XD3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tm4sf4Q91XD3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tm4sf4Q91XD3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tm4sf4Q91XD3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tm4sf4Q91XD3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tm4sf4Q91XD3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tm4sf4Q91XD3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tm4sf4Q91XD3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tm4sf4Q91XD3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tm4sf4Q91XD3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tm4sf4Q91XD3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tm4sf4Q91XD3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tm4sf4Q91XD3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Tm4sf4Q91XD3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms