Protein–RNA interactions for Protein: Q91VJ2

Cavin3, Caveolae-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin3Q91VJ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin3Q91VJ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin3Q91VJ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin3Q91VJ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin3Q91VJ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin3Q91VJ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin3Q91VJ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cavin3Q91VJ2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cavin3Q91VJ2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cavin3Q91VJ2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cavin3Q91VJ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cavin3Q91VJ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cavin3Q91VJ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms