Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB1

Ndc1, Nucleoporin NDC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc1Q8VCB1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ndc1Q8VCB1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ndc1Q8VCB1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ndc1Q8VCB1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ndc1Q8VCB1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ndc1Q8VCB1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ndc1Q8VCB1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ndc1Q8VCB1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ndc1Q8VCB1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndc1Q8VCB1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ndc1Q8VCB1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms