Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC34

Rpap2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase Rpap2, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpap2Q8VC34 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpap2Q8VC34 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rpap2Q8VC34 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpap2Q8VC34 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpap2Q8VC34 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Rpap2Q8VC34 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpap2Q8VC34 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpap2Q8VC34 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rpap2Q8VC34 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpap2Q8VC34 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms