Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBU8

Banp, Protein BANP, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BanpQ8VBU8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BanpQ8VBU8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BanpQ8VBU8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BanpQ8VBU8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BanpQ8VBU8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BanpQ8VBU8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BanpQ8VBU8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BanpQ8VBU8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms