Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RttnQ8R4Y8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RttnQ8R4Y8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RttnQ8R4Y8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RttnQ8R4Y8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RttnQ8R4Y8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RttnQ8R4Y8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RttnQ8R4Y8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RttnQ8R4Y8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms